Территория, рельеф.
Территория заповедника расположена на правом берегу реки Свирь от урочища «Старый Кол» (59 квартал) до устья, где Свирь впадает в Ладожское озеро. Общая площадь заповедника составляет 42390 га., из которых 5000 га., приходится на долю акватории Свирской губы Ладожского озера. Территория суши протянулась с севера на юг примерно на 41 км., а в наиболее широком месте – на 15 км. Границы заповедника на суше обозначены просеками, по которым стоят граничные знаки: указатели и аншлаги, предупреждающие о том, что здесь находится заповедник.
Границы заповедника:
СЕВЕРНАЯ - с запада на восток по границе Ленинградской области, с Карелией от берега Ладожского озера по западным просекам кварталов 96, 91., северным просекам кварталов 91,92,93,94,95,25 через Сегежское озеро разделяя его пополам, западным просекам кварталов 12,6,1северным просекам кварталов 1,2,3,4,5.
ВОСТОЧНАЯ - с севера на юг по восточным просекам кварталов 5,11,17,24,34,46, северной просеки 59 кв., далее по р. Свирь до юго-восточного угла (пересечения просек) 73 кв.
ЮЖНАЯ - по южной и западной просеке кв. 73, западной просеке 71 кв.,69 кв., восточной и южной просеке кв. 68, южным просекам кварталов 66,67, огибая здесь земли заповедника. Далее в 66 кв. граница вновь выходит на р. Свирь и проходит вниз по течению до протоки р. Лисья, огибая острова и протоки: о. Гнильное (кв.76), о. Сенные (кв. 87), верхнюю часть острова и протоки Корелка (кв. 142), которые входят в состав заповедника. В районах заливов Лахтинского и Засвирского - граница проходит по их устью.
ЗАПАДНАЯ - от р. СВИРЬ по фарватеру протоки Лисья, далее от устья протоки Лисья на северо-запад и север по акватории Свирской губы Ладожского озера на расстоянии 2,8 км. от берега до юго-западного угла в районе ур. Ситика.
Территория Нижне – Свирского государственного природного заповедника по ботанико – географическому районированию находится в Валдайско – Онежской подпровинции Северо - европейской таёжной провинции, Европейской таёжной области. Общий характер рельефа заповедника – равнинный. Наибольший интерес представляют формы рельефа озёрно - ледникового происхождения - береговые валы Ладожского озера и некоторые озёрные котловины. Формирование рельефа связано как с деятельностью волн древних морей, так и с работой проходившего здесь ледника. Рельеф слабо переработан эрозией. Высоты территории заповедника достигают 22-24 метров над уровнем моря (абсолютный максимум составляет 30,7 м.) Средняя отметка уровня Ладожского озера составляет 4 м. Уклон дна мелководной Свирской губы Ладожского озера незначителен - менее 10'.
Рельеф заповедника также носит следы антропогенных воздействий. На протяжении всей Великой Отечественной Войны 1941-1945 г.г. граница боевых действий проходила по р. Свирь. Её берега представляли собой военные укрепления, многочисленные следы которых видны до сих пор (окопы, землянки, насыпи военных дорог, противотанковые рвы и т.д.)